Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A6NNZ2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A6NNZ2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
A6NNZ2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NNZ2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NNZ2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NNZ2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NNZ2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NNZ2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A6NNZ2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NNZ2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NNZ2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NNZ2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NNZ2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NNZ2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NNZ2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NNZ2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NNZ2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NNZ2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NNZ2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
A6NNZ2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A6NNZ2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A6NNZ2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A6NNZ2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A6NNZ2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A6NNZ2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A6NNZ2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A6NNZ2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A6NNZ2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
A6NNZ2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A6NNZ2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A6NNZ2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A6NNZ2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A6NNZ2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A6NNZ2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
A6NNZ2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A6NNZ2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A6NNZ2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
A6NNZ2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A6NNZ2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A6NNZ2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A6NNZ2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A6NNZ2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A6NNZ2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A6NNZ2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A6NNZ2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A6NNZ2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A6NNZ2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A6NNZ2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A6NNZ2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A6NNZ2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A6NNZ2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A6NNZ2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A6NNZ2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A6NNZ2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A6NNZ2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
A6NNZ2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A6NNZ2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A6NNZ2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A6NNZ2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A6NNZ2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A6NNZ2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A6NNZ2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A6NNZ2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A6NNZ2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A6NNZ2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A6NNZ2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A6NNZ2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
A6NNZ2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A6NNZ2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A6NNZ2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A6NNZ2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A6NNZ2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A6NNZ2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A6NNZ2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
A6NNZ2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
A6NNZ2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
A6NNZ2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
A6NNZ2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A6NNZ2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A6NNZ2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A6NNZ2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A6NNZ2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A6NNZ2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
A6NNZ2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A6NNZ2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A6NNZ2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A6NNZ2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A6NNZ2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
A6NNZ2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A6NNZ2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A6NNZ2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A6NNZ2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A6NNZ2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A6NNZ2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A6NNZ2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A6NNZ2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A6NNZ2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A6NNZ2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A6NNZ2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms