Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRBA1A5PL33 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRBA1A5PL33 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms