Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR11A4FU01 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR11A4FU01 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR11A4FU01 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms