Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RRA0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0U1RRA0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms