Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPC4Q9UBN4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms