Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FBXL12Q9NXK8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms