Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms