Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms