Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX2Q99697 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms