Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP1Q99653 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHP1Q99653 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms