Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C2orf48Q96LS8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms