Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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RABGGTAQ92696 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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RABGGTAQ92696 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGGTAQ92696 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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