Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RPAP2Q8IXW5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPAP2Q8IXW5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPAP2Q8IXW5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPAP2Q8IXW5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPAP2Q8IXW5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPAP2Q8IXW5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPAP2Q8IXW5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPAP2Q8IXW5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPAP2Q8IXW5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPAP2Q8IXW5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms