Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TRAPPC6BQ86SZ2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TRAPPC6BQ86SZ2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TRAPPC6BQ86SZ2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TRAPPC6BQ86SZ2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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