Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms