Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms