Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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GEN1Q17RS7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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