Protein–RNA interactions for Protein: Q15542

TAF5, Transcription initiation factor TFIID subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF5Q15542 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF5Q15542 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF5Q15542 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF5Q15542 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF5Q15542 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF5Q15542 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF5Q15542 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF5Q15542 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF5Q15542 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms