Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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