Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM2Q13029 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
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