Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPCQ01831 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPCQ01831 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPCQ01831 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPCQ01831 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPCQ01831 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms