Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PGGT1BP53609 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PGGT1BP53609 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PGGT1BP53609 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PGGT1BP53609 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PGGT1BP53609 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGGT1BP53609 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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