Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA5P52803 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms