Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms