Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLSTN1O94985 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLSTN1O94985 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms