Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GMNCA6NCL1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GMNCA6NCL1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms