Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35F4A4IF30 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms