Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TTF2Q9UNY4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TTF2Q9UNY4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms