Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTLNQ9NXG0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTLNQ9NXG0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms