Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms