Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms