Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CADM1Q9BY67 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms