Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms