Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC39A3Q9BRY0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A3Q9BRY0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms