Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms