Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms