Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C17orf47Q8NEP4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf47Q8NEP4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms