Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms