Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC1Q6VVB1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC1Q6VVB1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC1Q6VVB1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC1Q6VVB1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC1Q6VVB1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC1Q6VVB1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC1Q6VVB1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC1Q6VVB1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC1Q6VVB1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC1Q6VVB1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC1Q6VVB1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC1Q6VVB1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms