Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01545Q5VT33 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms