Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms