Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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