Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms