Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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COL4A6Q14031 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL4A6Q14031 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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