Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFFO1Q0D2I5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms