Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms