Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGDP52209 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGDP52209 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms