Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ME1P48163 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ME1P48163 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ME1P48163 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ME1P48163 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ME1P48163 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ME1P48163 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ME1P48163 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ME1P48163 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ME1P48163 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ME1P48163 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ME1P48163 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms