Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GCAP28676 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCAP28676 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms