Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA4P13612 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms